PROGETTAZIONE MOLECOLARE E RELAZIONI STRUTTURA PROPRIETA'
Anno accademico 2016/2017 - 1° annoCrediti: 6
SSD: CHIM/06 - CHIMICA ORGANICA
Organizzazione didattica: 150 ore d'impegno totale, 108 di studio individuale, 42 di lezione frontale
Semestre: 2°
Obiettivi formativi
Obiettivo del corso è la selezione“intelligente” di nuove strutture da sintetizzare utilizzando le potenzialità della chemioinformatica nella progettazione molecolare
Prerequisiti richiesti
Conoscenze di base di chimica organica e statistica multivariata
Frequenza lezioni
Obbligatoria
Contenuti del corso
Rappresentazione delle strutture molecolari e creazione di databases strutturali. La meccanica molecolare. La dinamica molecolare. Le cariche negli atomi e nelle molecole. Descrittori molecolari. Metodologie multivariate per lo studio delle relazioni quantitative fra struttura molecolare e proprietà macroscopiche (QSPR) o attività biologica (QSAR).
QSAR. Il docking molecolare. Il metodo GRID. Due importanti descrittori molecolari: pKa, log P. Profili farmacocinetici e proprietà ADME. Volsurf nella farmacocinetica. FLAP (Fingerprint For Lingand And Protein). Selezione delle molecole più informative e ottimizzazione di proprietà molecolari per ADME: screening veloce, chimica combinatoriale, screening virtuali e filtering delle strutture. Esempi di Computer Aided Drug Design.
QSPR. Ottimizzazione di prodotti e/o di processi in funzione di dati strutturali, analitici, spettroscopici, parametri di reazione e/o tecnologici
Testi di riferimento
appunti dalle lezioni
Programmazione del corso
Argomenti | Riferimenti testi | |
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1 | Rappresentazione delle molecole in databases strutturali, Descrittori molecolari globali e parziali. Metodi di correlazione. Il metodo PLS. QSAR QSPR |
Verifica dell'apprendimento
Modalità di verifica dell'apprendimento
Orale
Esempi di domande e/o esercizi frequenti
Domande su tutti gli argomenti del corso